与植物、动物一样，微生物对污染环境也具有抗性，甚至更强。由于()和生态上与植物、动物很不相同，所以它对环境污染物的抗性机理在有些方面有别于前两生物。一般来说，微生物对污染物的抗性也可分为避性、分解转化等途径。