某机电安装公司承建一项大型图书馆机电安装工程。合同造价3600万元，其中主材料费和设备费占60%，工期为10个月。合同约定：工程进度款按月结算。开工前业主向承包商支付合同价20%的工程预付款，当工程进度款达到合同主材料费和设备费价的60%时，开始从超过部分工程价款中抵扣工程预付款，竣工前全部扣清。工程竣工验收交付使用后的保修金为合同价3%，竣工结算月一次扣留。 问题：该工程验收合格后，进行竣工结算时还应考虑哪些费用应抵扣或扣留？