委托（合作）研发的主要风险是：委托（合作）单位选择不当，研究成果转化应用不足，导致资源闲置，知识产权界定不清。合作研发还包括与合作单位沟通障碍、合作方案设计不合理、权责利不能合理分配、资源整合不当等风险。