2001年11月9日，国土资源部发出了《关于依法加快集体土地所有权登记发证工作的通知》，决定在已有的基础上，进一步加大力度，全面部署开展全国集体土地所有权初始登记工作，并强调要严格按照《中华人民共和国土地管理法》的规定，确定集体土地所有权主体。考虑到各地的差异和村民小组组织机构不健全的实际，在具体登记发证时，可采取哪些方式进行？